1、有机肥料
有机肥料又称农家肥料，如堆肥、饼肥、绿肥等，其来源丰富广泛，含有大量氮、磷、钾及其他多种营养元素，长期施用能增进土壤的团粒结构，改良土壤性质，提高土壤的保肥、保水能力及通气性，具有迟效、速效和肥效长的多方面结合而发挥作用的特点，对多年生及根和地下茎类中草药如山药、细辛、人参、桔梗等施用效果较好。现将几种有机肥料的使用分别介绍如下：
①饼肥。饼肥对中药的品质有较好的作用，腐熟的饼肥可适当多用。一般高氮油饼不含有毒物质，作为肥料只要需粉碎就能施用。含氮量低的油饼常含有皂素或其他有毒物质，做肥料时需先经发酵，清除毒素。含毒素的油饼有菜籽饼、茶子饼、桐子饼、蓖麻子饼、柏子饼、苍耳子饼、花椒干饼和椿树子饼等。
②人、畜粪尿。人、畜粪尿必须要经过贮存、腐熟后才适宜施用。严禁在中药植株上浇不腐熟的人、畜粪尿。原因有三：一是新鲜人、畜粪尿含多种病菌病毒。二是新鲜人、畜粪尿难以被植物吸收利用，且不易被土壤所保蓄。三是新鲜人、畜粪尿所含盐分和养分浓度过高，会使土壤养分分布不匀而影响作物的生长。
③绿肥。我国肥源丰富，目前已栽培利用和可供栽培利用的绿肥植物就有200余种，是中药材gap种植中有待开发利用的重要天然肥源。在我国南方各省主要利用冬闲田栽培紫云英、金花菜、箭舌豌豆、肥田萝卜以及蚕豆、豌豆和油菜等作为来年主要作物的肥源，而北方各省区以一年生绿肥居多，种类有箭舌豌豆、草木犀、绿豆等。
④秆肥。秆肥是重要有机肥源之一，作物秸秆含有相当数量的为作物所必需的营养元素，在适宜条件下通过土壤微生物或牲畜消化的作用，可使营养元素返回土壤，被作物所吸收利用，称作秸秆还田。秸杆还田可采取堆沤还田、过腹还田（牲畜粪尿）、直接翻压还田、覆盖还田等多种形式。操作时秸秆要直接翻入土中，注意与土壤充分混合，不要产生根系架空现象，并加入含氮丰富的人、畜粪尿、也可用一些氮素化肥，调节还田后的碳氮比为20：1。
⑤微生物肥料。微生物肥料是用特定微生物菌种培养生产的具有活性的微生物制剂，具有无毒无害，不污染环境的特点，对减小中药材硝酸盐含量，改善中药材品质有明显效果，可用于拌种、做基肥或追肥时使用。
⑥叶面肥料。叶面肥料是喷施于植物叶片并能被其吸收利用的肥料，可含少量天然的植物生长调节剂（不得使用化学合成的植物生长调节剂）。一般是由天然有机物提取液或接种有益菌类的发酵液配加维生素、藻类、氨基酸等营养元素制成，也有一些是微量元素肥料。可施用1次或多次，但最后一次须在收获前20天喷施。
⑦其他肥料。如锯末、刨花、木材废弃物、不含防腐剂的鱼渣、骨粉、骨胶废渣、家禽家畜加工废料、糖厂废料、城巿生活垃圾等。使用前一定要经过无害化处理，达对标准后才能使用，而且每年每公顷农田限制用量黏性土壤不超过45吨，沙性土壤不超过30吨。
2、无机肥料
无机肥料又称化学肥料，如尿素、过磷酸钙、氨水等。这类肥料仅含一种或两种无机肥效成分，有效养分高，肥效快，但易造成土壤板结，有些肥料还对植物和土壤有选择性。全草类、叶类、果实种子类、花类中草药植物，可适当施用化肥，但必须与有机肥配合使用。
3、微量元素肥料
如硼酸、硫酸锌、硫酸铜等，多用来浸种成根外施肥。使用此类肥要注意选择合适的浓度和用量，在确保肥效和药效的情况下，可结合病虫害防治，将肥料与农药混合喷施。
追肥以速效肥料为主，且在非雨天施用为好。为了及时而充分地满足中药材在生长发育进程中对养分的需要，必须在其生长发育的不同时期，分期、分批施用。多年生中药材常于返青、分蘖、现蕾、开花等不同时期施用。以种子和果实为药的中药材，在蕾期和花期追肥为好。以根、根茎、鳞茎类为药的中药材，在地下部膨大期追肥可获高产。一年多次收获的中药材应在每次收获后及时追肥。追肥时应留意肥料的品种、浓度和用量，免得引起肥害。
