孔雀疾病的种类很多，有病毒、霉菌体、细菌、寄生虫所引起的传染病；有营养不良和缺乏某种营养元素引起的营养性代谢障碍性疾病；有中毒、过热、寒冷等环境导致的生理机能障碍性疾病。当前对孔雀养殖威胁最大的是传染病，能导致孔雀大批死亡，造成重大经济损失。必须坚持预防为主，综合防治的方针，及时采取综合防治措施。
1消灭传染源
传染源是被感染上传染病或带有病原体的动物及其死体，包括排泄物和被污染的物品。及时发现和消灭传染源，防止带有病原体的动物进入养殖场，是预防传染病的重要环节。
(1)把好引种关。坚决杜绝从有传染病的养殖场引进孔雀及种蛋。对引种用的车辆、用具和人员要进行严格消毒杀菌，引进的种蛋要连同装蛋箱立即进行熏蒸消毒，对新引进的孔雀耍隔离观察并消毒，发现病、死孔雀要及时处理。
(2)在饲养过程中，随时密切观察孔雀的动态，一旦有异常反映，要立即查找原因。如发现可疑的孔雀，要及早确诊，并及时采取措施，防止传染源扩散。对病残和死亡的孔雀要放入塑料袋中，送兽医部门疹断或深埋、烧毁。
(3)一经确诊孔雀群有疫情，应采取果断措施，在兽医的指导和监督下，实行严格封锁，并根据疫情的性质及危害程度对孔雀全部或部分（有病及代菌的）进行处理。对孔雀的笼舍、用具、孔雀群及周围环境进行反复消毒，防止疫病扩散。
2．切断传染途径
传染途径有直接接触传染和间接接触传染，除对传染源严格隔离与消灭外，重要的是对传播媒介如饲料、用具、饮水、设备、运输工具、工作人员用品、空气中的尘埃以及野禽、老鼠、昆虫等的妥善处理。
(1)孔雀场的选址要恰当，布局要合理。
(2)孔雀场门口及笼舍门口都要设消毒池，对进出车辆和人员要进行消毒，笼舍用具要专用，饲养人员使用专用工作服，相互间不得走动，防止野禽、家禽、猫、狗、鼠等动物进入孔雀饲养区域。
(3)对笼舍和周围环境要经常清扫和消毒，对笼舍内的用具、设施设备要定期消毒，注意笼舍的通风换气。
(4)每天清除的粪便及被污染的垫料要集中堆放发酵，做好笼舍污水的排出和处理。
(5)防止饲料和饮水的污染，饲料要妥善贮存和使用，饮水要清洁卫生，饲槽和饮水器要经常清洗消毒。
3增强孔雀的免疫力
增加孔雀自身对疫病的抵抗能力。
(1)搞好饲养管理，增强孔雀体质。按照孔雀不同的发育时期对营养物质的需要，给予全价饲料喂养。为孔雀创造一个安静、清洁、舒适、良好的生活环境，保持新鲜的空气、适宜的温度和湿度、合理的光照和养殖密度。
(2)按照孔雀的免疫接种程序，进行疫苗的免疫接种，增强对传染病的抗病免疫能力。如孔雀出壳24小时进行马立克氏疫苗免疫接种：7-10日龄作新城疫Ⅱ系疫苗接种首免：13-14日龄接种鸡痘疫苗：25-30日龄作新城疫Ⅱ系疫苗接种二免；青年孔雀接种新城疫I系疫苗；成年孔雀每年接种一次新城疫I系疫苗。定期投喂驱虫药（如左旋眯唑、丙硫苯咪唑等）防治寄生虫。
