1、西红柿早疫病：西红柿早疫病也叫斑点病，病斑圆形或近圆形，黑褐色，主要危害西红柿叶片，有时危害茎果，高温高湿易发病，病菌为真菌类半知菌。要及时通风排湿减少早疫病发生，防治早疫病可用75%百菌清或50%异菌脲各按600倍喷雾防或治效果良好，熏棚可用百菌清烟雾剂熏棚。
2、西红柿晚疫病：西红柿晚疫病属真菌类卵菌，以发病快发病重破坏性强而成为西红柿最主要的防治对象，一般晚疫病先从叶缘开始侵入，继而发展成黑褐色大斑，并侵染茎和果实，致茎杆变黑褐色绕茎一周，果实发病不变软，初呈油浸状暗绿色后变黑褐色。病菌借风雨和浇水传播，温度低湿气大通风差发病重。晚疫病可用霜洗600倍喷雾防治，病害严重时，可用烯酰吗啉加准能喷雾防治，烟雾剂可用霜疫灭烟剂熏棚。
3、西红柿绵疫病：西红柿绵疫病属真菌类卵病，俗称“掉蛋”。初发病叶片发生褪绿病斑，继而水浸状腐烂，果实发病多发生在肩台部位，出现淡褐色病斑后逐渐病斑现输纹状，湿度大长出绵状物白霉。绵疫病高温高湿或地温高湿发病重。防治绵疫病可与防治晚疫病用同一类药，可用甲霜霜霉加琥铜（甲霜铜）喷雾防治，也可用大良加烯酰吗啉喷雾防治。
4、西红柿灰霉病：西红柿灰霉病属真菌类半知菌，病菌先浸染花及花柱，然后传染叶片及果实，叶片病菌先从叶尖开始发病呈三角形往里浸入发展，病斑黑褐色，长黑毛，果实发病先从果柄处腐烂产生黑毛。灰霉病是继晚疫病后第二大病害，阴雨天、温度低棚内湿度大露水多发病重，要及时通风排湿，防治灰病害可用腐霉利600倍或美无痕600倍喷雾防治，烟雾剂可用灰霉斯烟剂熏棚。
5、西红柿叶霉病：西红柿叶霉病属真菌类半知菌，主要危害叶片，发病叶片正面出现不规则黄斑，叶背生黄褐斑绒状霉层，防治叶霉病最好最安全无副作用的有榜中榜（10%多抗霉素）按规定剂量喷倾城或叶秀防治效果也非常好，平常预防可用70%甲基托布津或50%多菌灵可杜绝和减轻叶霉病地发生。
6、西红柿细菌性溃疡病：西红柿溃疡病属细菌类，主要危害茎和果实，发病多由伤口浸入，病菌在茎皮内部迅速扩散，发展至髓部溃烂变褐色枯死，果实发病果面出现疱疹状略隆起的白色晕圈，也称“鸟眼病”或“圈圈病”。防治细菌性溃疡病平常可用迅补即叶枯唑预防，发病严重地块可用大良600倍加迅补600倍防治效果良好。
7、西红柿细菌性斑点病：斑点病包括芝麻斑病和斑疹病、缘枯病，主要危害叶片，细菌性斑点病叶片常出现较小的圆形或多角形褐色病斑，较密集和透明。防治细菌性病害可用柔通（绿乳铜）600倍喷雾也可用大良600倍喷雾，可兼治细菌性软腐病。
8、西红柿病毒病：西红柿病毒病有6种类型花叶型、蕨叶型、卷叶型、黄顶型、巨芽型、条斑型，主要防治对象是花叶型和条斑型病毒为主。西红柿病毒病原主要有烟草花叶病毒（tmv）黄瓜花叶病毒（cmv）苜蓿花叶病毒（amv）三种毒源。病毒病除种子带毒处，一般有蚜虫、飞虱、蓟马等害虫为病毒传播媒介。防治病毒病要彻底清除田园附近杂草，消灭棚内外昆虫，种子消毒可用10%磷酸三钠浸种45分钟后用清水冲干净捞出，晾干后生芽。病毒病发生后，可用抗毒丰（5%菇类蛋白多糖水剂）300倍加小叶敌500倍混加硕金808（0.1%芸苔素内酯）防治效果非常好。
9、西红柿枯萎病：西红柿枯萎病包括立枯、青枯病。枯萎病统一的症状是叶片中午萎蔫早晚恢复，发病严重的很难在早晨恢复并死棵，剖开病茎，可见维管束变褐，水份营养受阻而不能正常输送。防治枯萎病早期预防可喷“溃汰”一桶1包，10天喷一次预防枯萎病效果好，发现病株可用甲基立枯磷600倍加溃汰加妙回田30斤水各加一包灌根预防，也可用洛氨铜单独灌根。
10、西红柿脐腐病：西红柿脐腐病发生的症状就是果实脐部发生水浸状腐烂，属生理性病害。大棚内长时间干旱特别在座果期不浇水，座住果后又浇一大水会造成严重而大量脐腐病果，所以浇水不均匀是造成脐腐病发生的主要原因。第二是土地缺钙也是造成脐腐病根源，土地缺钙出现生长点坏死果实发生脐腐，对因缺钙引起脐腐病的大棚建议使用陕西宝鸡生产的美林钙瓶装水剂防治效果最好。
11、白粉虱：可喷70%吡虫啉（金刹）加扑虱灵加1000倍害立平虫卵兼治。
12、根结线虫：可用深圳瑞德丰3%阿维菌素1000倍每株灌药液半斤防治效果好。
