番茄前期育苗床保持1厘米厚的水层，待番茄幼苗子叶伸展开后，向苗床施用营养液，按无土栽培肥的配方（1吨营养液中.l号肥1.5千克、2号肥l千克），配制际准液，使用前视幼苗的发育阶段，逐渐由1/2标准液增加至2/3标准液，定植前达到完全标准液的浓度，营养液的ec值控制在1.1-1.6毫西门子／厘米。如果夏季超过2毫西门子／厘米，冬季3毫西门子／厘米，将对幼苗的后期生长产生不良影响。
营养液的ph值控制在5.8-6．0之间，温度控制在白天气温23-28℃。前半夜14-16℃，后半夜12-13℃，液温20-23℃。秋季育苗应控制高温引起的幼苗徒长，在3-5叶期喷施100毫克／升(ppm)的多效唑或矮壮素。育苗期间如自然光照不足，需增加人工光照，在低光照时幼苗的营养液浓度可以加倍，特别注意保证硼的供给，如能增施二氧化碳也将促进幼苗的发育。
番茄果实膨大需供应大量的营养，此时每株番茄日消耗营养液由0.5升提高到1.5升，营养液从结果期开始改为b配方（1吨营养液中，1•5千克1号专用肥、l千克2号专用肥、0．3千克3号专用肥），营养液供应次数白天6-8次，晚间1-2次。ec值控制在1.4-2.4毫西门子／厘米，开花膨大期为1.4-1.8毫西门子／厘米，收获期为1.6-2.4毫西门子／厘米，番茄营养液浓度管理重点是收获期，应加强更新，随时补充来保持，这洋才能保证果实的糖度，提高品质。营养液的ph值控制在5.8-6.0，因为ph值6.4或高于6.4磷酸氢钙和碳酸盐开始沉淀，如低到ph3.0时磷酸铁盐开始沉淀，从而控制营养缺乏症的发生。
无土栽培的番茄因生态条件温度偏低、光照不足及管理措施不当，营养供给不足等因素影响正常受粉、受精，导致落花落果，必须进行生长素处理，如10-20毫克／升(ppm)的2.4-d蘸花（温度高时用低浓度、温度低时用高浓度），在早上8、9时将刚刚开放的花轻轻在药液中沾一下或用笔蘸抹在雌蕊的柱头上。或用25-50毫克／升(ppm)的对氯苯氧乙酸钠盐处理，药液中可加入0.l%磷酸二氢钾和0．05%的硼酸，从而促使营养液流向花和果实，提高产量，促进成熟。注意；处理不当易产生畸形果。
