付图兵开底后车准也找向东,武汉大学讲座教授。聘任岗位:生物化学与分子生物学。博士生导师。1957年11月7日生,1982年毕业于武汉大学病毒学学系。1988年获凯西保留地(凯斯西储)大学生物化学博士学位,1992年获哈佛大学分子生物学博士后。来自现任美国加州大学圣360百科地亚哥分校细胞与分子盾图扬执房些育晶否医学系教授、美国先进科学协会会员,RNA协会会员、白血病班曾既与淋巴癌协会委业虽满地证员、美国生物医学科学RayWu协会会员。
- 中文名 付向东
- 出生日期 1957年11月7日
- 职业 讲座教授
- 毕业院校 凯西保留地(凯斯西储)大学
- 性别 男
人物经历
学习经历
1977-1982: 武大病毒系, 本科。
1983-1988: Case Western Reserve University, Biochemistry, 博士。
1988-1992: Harvard University, 博后。
工作经历
1992-1998: Assistant Professor, UCSD
1998-2002: Associate Professor with T来自enure, UCSD
2002-present: Full Professor, UCSD
候只有袁家新 2004-pr360百科esent: Lecture Professor, 武汉大学生科院。
主要社会兼职:
科技歌条阳模状井动许载轴部蛋白质重大研究计划专家组成员。
研究方向
RNA processing and regulation
microRNA biogenesis and functions
客例 Transcription and mRN婷语A processing coupling
Functional genomics
Genetics and epigenetics regulation of gene expression
主要贡献
代甚雷低夫规打投来握获章表性论文
(部分或完全在武大完成的工作):
1. Xue, Y-C., Zhou, Y., Wu, T-B., Zhu, T., Ji, X., Zhang, C., Kwon, Y-S., Yeo, G., Sun, H., Fu, X-D.*, and Zhang, Yi* (2009). 来自Genome-wide analysis of PTB-RNA interactions re究某生燃快又调木来快再veals a strategy used by the general splicing repressor to modulate exon inclusion or skipping. 抗功帝凯航华论轴左陆Molecular Cell 36:996-1006. (*co-corresponding authors).
2.Ji, X and Fu, X-D. (2012). The mediator couples transcription and splicing. Molecular Cell 45:43克六预苗若架3-434.
3.Xiao, R., Tan脱犯证来占角杨今垂g, P., Yang, B., Huang, J., Zhou Y., Shao C-W., Li, H., Sun, 360百科H., Zhang, Y., a封自冷慢异氢nd Fu, X-D. (2012操际态银越间轮备染). Nuclear matrix factor hnRNP U/SAF-A exerts a global control of alternative splicing by regulating U2 snRNP maturation. Molecular Cell 45:656-668.
4.Xue, Y-C., Ouyang, K., Huang, J., Zhou, Y., Ouyang, H., Li, H., Wang, G., Wu, Q., Wei, C., Bi, Y., Jiang, L., Cai, Z., Sun, H., Zhang, K., Zhang, Y., Chen, J., and Fu, X-D. (2013) Direct conversion of fibroblasts to neurons by reprogramming PTB-regulated microRNA circuits.具日土饭福脸曲数齐致Cell 152:82-96.
5. Ji, X., Zhou, Y., Pandit措虽矛浓训形培, S., Huang, J., Li, H., Lin, C. L., Rui, X., Burge, C. B., and Fu, X-D. (2013). SR protein争几怀需律九s collaborate with 7SK and promoter-ass鲁四训足照望精掉独青支ociated nascent RNA to release paused polymerase.Cell 153:855-868..
最新论文
哺乳动物福达四中超过70%的蛋白编码基因具有多个polyA位点,不同po旧齐北修科案针协lyA位点的选择被称为可变多聚腺苷酸化(Alt质析染ernative polyadenyl评ation,APA)【1】。眼都团和另秋盟态续两持APA过程的失调与很多疾病相字关联【2】。现有理论认为却左位片命,APA发生过程中近端polyA位点和远端polyA位点的加工都是共转录发生的,二者相互独立【1,3】。
1月10日,生命科学学院、病毒学国家重点实验室周宇教授研究组和加州大学圣地亚哥分校付向东教授合作在知名学术期刊《自然•结构与分子生物学》(Nature Structural & Molecular Biology)在线发表题为“渐进式激活远端和近端PolyA位点的可变多聚腺苷酸化”(Alternative polyadenylation by sequential activation of distal and proximal PolyA sites)的研究论文。
周宇和付向东为该研究论文的共同通讯作者,武汉大学生命科学学院博士后唐鹏和博士杨阳为该论文的共同第一作者,李广楠、黄丽等研究生参与了研究。该研究工作得到了武汉大学生科院徐永镇教授、中科院水生所罗大极研究员的帮助和支持。
该研究发现,细胞中的许多基因在远端polyA位点加工产生的长3′UTR转录本会滞留于染色质或核基质(nuclear matrix),这些已加尾的转录本可进一步在近端polyA位点加工,产生短3′UTR转录本释放到细胞质,他们把这种两步渐进式加工的新模式称为“sequential polyadenylation”。
在研究RNA核滞留问题的过程中,作者发现未完全剪接的polyA+ RNA会滞留于染色质或核基质,他们同时也观察到许多基因选择远端polyA位点产生的长3′UTR转录本也会滞留于染色质或核基质。为了探究这些转录本滞留于核基质的原因,他们系统地鉴定了与核基质polyA+ RNA结合的RNA结合蛋白(RBPs),这些蛋白包括很多剪接因子,这是转录后剪接预期的一个结果。然而,出乎预料的是许多polyadenylation加工的因子也被鉴定到,这些因子从理论上来说,应该在完成polyA位点加工之后即与polyA+ RNA分离。由此推测,这些polyadenylation因子可能结合到长3′UTR转录本的近端polyA位点,并可能进一步加工而产生短3′UTR转录本。为了证明这一猜想,作者首先比较了近端和远端polyA位点的强弱,结果发现和以前报道一样,远端polyA位点要强于近端polyA位点。因此,从理论上说远端polyA位点可能会被优先加工。同时他们还比较了新生RNA和稳定状态下总RNA在近端和远端polyA位点的使用比率,结果发现大部分基因的新生RNA,其远端polyA位点使用比率确实要比总RNA的比率显著增高,而且这一现象不是由于长3′UTR转录本更容易降解造成的,进一步佐证了两步加工的可能性。
为进一步获得直接的证据,作者考虑到在此两步加工模型中,长3′UTR转录本应该是短3′UTR转录本加工的中间产物,它的降解应该也会导致短3′UTR转录本的同步减少。由此作者设计了一组核酶实验,把核酶插入到长3′UTR转录本那段特有的3′UTR区域来引发长3′UTR转录本的降解,结果正如预期一样,短3′UTR转录本表达量也显著下降,说明长3′UTR转录本确实可作为中间底物。更重要的是,作者开发了一个新的Cleave-seq方法,在抑制5′-3′核酸酶外切酶活性的条件下,可检测到在从长3′UTR转录本加工成短3′UTR转录本过程中所产生的3′端产物。
基于以上证据,作者提出了APA渐进式加工的新模式“sequential polyadenylation”(图1)。进一步的实验发现“sequential polyadenylation”可以一种“空间换时间”的间接方式来调控内含子的剪接。作者推测“sequential polyadenylation”可与不同的转录后加工事件相偶联,可能是一种转录后调控基因表达的多用途策略。